1. 非特异性杂交:
- 问题:杂交信号中非特异性的背景增加。
- 解决:使用更高浓度的非放射性同源DNA或RNA来竞争,减少非特异性的结合。
2. 杂交信号弱:
- 问题:杂交信号不强,无法得到清晰的定位或定量结果。
- 解决:增加探针浓度,调节杂交条件,减少洗涤强度,使用更敏感的检测系统。
3. RNA降解:
- 问题:RNA稳定性差,容易被降解。
- 解决:使用最佳固定剂和条件,避免使用过度的蛋白酶K消化。
4. 组织或细胞渗透性差:
- 问题:探针不易渗透到组织或细胞中。
- 解决:增加切片前的处理步骤,如使用蛋白酶消化或增加切片厚度。
5. 探针稳定性问题:
- 问题:探针的稳定性不足,容易降解。
- 解决:使用稳定的探针,冷冻干燥储存,避免多次冻融。
6. 杂交不均匀:
- 问题:不同区域的杂交信号不一致。
- 解决:确保杂交液完全覆盖样品,并且杂交过程中保持恒定的温度和湿度。
7. 背景染色:
- 问题:染色过程中产生非特异性的背景染色。
- 解决:增加洗涤步骤,使用特异性更强的抗体和探针。
8. 信号定位不准确:
- 问题:杂交信号的定位不够精确。
- 解决:选择更适合的探针标记物,优化杂交和洗涤条件。
9. 探针设计不当:
- 问题:探针与目标序列的互补性不佳。
- 解决:设计特异性更强、更稳定的探针。
10. 实验操作错误:
- 问题:操作不当导致实验结果偏差。
- 解决:严格遵守操作规程,进行实验培训,详细记录所有步骤。
11. 光照或化学损伤:
- 问题:样本在检测过程中受到损伤。
- 解决:使用适当的遮光保护,缩短光照时间。
12. 检测系统的灵敏度不足:
- 问题:使用的检测系统灵敏度不足以检测到弱信号。
- 解决:考虑更换更灵敏的检测系统或增加信号放大步骤。